4月4日,澎湃新聞記者從復旦大學附屬腫瘤醫(yī)院獲悉,該院院長虞先濬教授團隊聯(lián)合北京大學腫瘤醫(yī)院、中國科學院上海藥物研究所、上海長海醫(yī)院、中國科學院分子細胞科學卓越創(chuàng)新中心,歷時五年研究,成功繪制全球首張無功能性胰腺神經(jīng)內分泌瘤多組學全景圖譜,并根據(jù)圖譜突破性提出這種“沉默腫瘤”的分子分型框架、預后模型和靶向-免疫治療新策略,為臨床精準診療提供了重要依據(jù)。國際頂級腫瘤學期刊《癌細胞》(Cancer Cell)同日發(fā)表該項重要研究成果,影響因子為48.8分。
虞先濬教授團隊聯(lián)合北京大學腫瘤醫(yī)院、中國科學院上海藥物研究所、上海長海醫(yī)院、中國科學院分子細胞科學卓越創(chuàng)新中心,歷時五年研究,成功繪制全球首張無功能性胰腺神經(jīng)內分泌瘤多組學全景圖譜。復旦大學附屬腫瘤醫(yī)院供圖
歷時5年攻關,繪制出全景分子圖譜
神經(jīng)內分泌腫瘤起源于神經(jīng)內分泌細胞,這種細胞遍布人體各處,胃、腸、胰腺等消化系統(tǒng)最常見,在我國患者中發(fā)生在胰腺部位的最多。
胰腺神經(jīng)內分泌瘤是發(fā)生在胰腺的第二大常見腫瘤,約90%為無功能性。這類無功能性胰腺神經(jīng)內分泌瘤早期沒有癥狀,因而也被稱作“沉默的腫瘤”。其中約半數(shù)患者確診時已發(fā)生轉移,特別是肝轉移,且接受根治手術后也有不少患者容易復發(fā),在臨床上缺乏有效預測預后的分子標志物,綜合治療療效有待提高。
歷時五年攻關,虞先濬教授團隊聯(lián)合多中心研究團隊,整合基因組、轉錄組、蛋白質組和磷酸化修飾組四種組學數(shù)據(jù),繪制了全球首個無功能性胰腺神經(jīng)內分泌瘤蛋白基因組學全景分子圖譜。
團隊通過對108例中國無功能性胰腺神經(jīng)內分泌瘤患者開展全外顯子組、轉錄組、蛋白質組及磷酸化修飾組的多維度整合分析,繪制出全景分子圖譜,揭示了MEN1、ATRX、DAXX基因突變通過干擾染色質結構穩(wěn)定性和激活mTOR通路驅動腫瘤惡性演進的機制。
研究團隊還通過MEN1基因條件性敲除小鼠模型,驗證了MEN1缺失觸發(fā)代謝重編程和增殖信號交叉激活的惡性循環(huán),從而導致染色體分離至關重要的CENPV蛋白下調,填補了該領域機制研究的空白。另外,CDK5、WASL等基因的拷貝數(shù)擴增被發(fā)現(xiàn)為無功能性胰腺神經(jīng)內分泌瘤生長的驅動因素,有望成為靶向治療的潛在“靶標”。
篩選“靶標”建立預后模型,有效預測患者生存預后
研究團隊發(fā)現(xiàn),在無功能性胰腺神經(jīng)內分泌瘤患者的臨床診療中,傳統(tǒng)腫瘤分期及病理分級難以滿足個體化治療的需求。
為了解決這一臨床困境,研究團隊基于海量蛋白質組數(shù)據(jù),利用前期研發(fā)的ReProMSig 平臺基于人工智能算法篩選出GNAO1、INA、VCAN三個蛋白質,構建了預后標志物特征譜和預后模型,為無功能性胰腺神經(jīng)內分泌瘤的預后判斷提供了重要工具。
據(jù)介紹,該模型在包含345例患者的四組獨立隊列中均展現(xiàn)出優(yōu)良的預測效能和區(qū)分效果:高?;颊呶迥晟媛蕛H為51.4%,而低危組則高達97.8%。更具臨床意義的是,研究團隊還證實分泌蛋白VCAN在患者血漿中的濃度與腫瘤進展顯著相關,這一發(fā)現(xiàn)有望推動診療模式從“有創(chuàng)組織活檢”向“無創(chuàng)血液檢測”跨越。
與此同時,研究團隊進一步通過蛋白質組學特征聚類分析,將無功能性胰腺神經(jīng)內分泌瘤患者劃分為四種分子亞型。其中,C1亞型的腫瘤以免疫抑制微環(huán)境和EMT通路激活為特征,患者預后最差,急需探索免疫聯(lián)合療法;C2亞型表現(xiàn)出異?;钴S的氧化磷酸化活性; C3亞型由MYC 異常激活和失控的細胞周期信號主導;C4亞型則在VHL突變驅動下形成獨特的缺氧生態(tài)。
研究團隊后續(xù)的藥物研究證實了“四分型”的準確性?;诟鱽喰吞禺惣せ畹牡鞍准っ负捅磉_和活性上調蛋白,團隊利用患者來源類器官(PDO)開展了藥物篩選并利用患者來源腫瘤異種移植模型(PDX)進行驗證,證實CDK5抑制劑可抑制四種分子亞型的腫瘤生長;鈣離子通道阻滯劑(如心血管疾病經(jīng)典藥物鹽酸胺碘酮)與 CDK5 抑制劑兩藥聯(lián)用在C2亞型中表現(xiàn)出更好的抑瘤效果;目前臨床運用的mTOR 抑制劑可較好抑制C4 亞型腫瘤。這些證據(jù)顯示,基于“四分型”的“分型而治”策略,為個體化精準治療提供了科學依據(jù)。
(原標題:破解臨床困境,我國專家為“沉默腫瘤”繪制全球首張全景圖譜)
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